Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TVP23BQ9NYZ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TVP23BQ9NYZ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TVP23BQ9NYZ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms