Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RDH8Q9NYR8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms