Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDE1Q9NXR1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDE1Q9NXR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDE1Q9NXR1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms