Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2LQ9NUG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2LQ9NUG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms