Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GINM1Q9NU53 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GINM1Q9NU53 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GINM1Q9NU53 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms