Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD2Q9NRG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD2Q9NRG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD2Q9NRG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms