Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BATF3Q9NR55 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BATF3Q9NR55 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BATF3Q9NR55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms