Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A3Q9NQ40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A3Q9NQ40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms