Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZCCHC17Q9NP64 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZCCHC17Q9NP64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZCCHC17Q9NP64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms