Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPA3Q9H6K4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPA3Q9H6K4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPA3Q9H6K4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms