Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOC1Q9H4F8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOC1Q9H4F8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMOC1Q9H4F8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 349.9 ms