Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TGIF2Q9GZN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGIF2Q9GZN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGIF2Q9GZN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF2Q9GZN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms