Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDEM3Q9BZQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EDEM3Q9BZQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EDEM3Q9BZQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms