Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM3Q9BZL3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms