Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFXN3Q9BWM7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFXN3Q9BWM7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFXN3Q9BWM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms