Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SDF4Q9BRK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDF4Q9BRK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDF4Q9BRK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms