Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF4Q9BQW3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF4Q9BQW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF4Q9BQW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms