Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRG3Q99928 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRG3Q99928 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRG3Q99928 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms