Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRNT1Q96Q11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNT1Q96Q11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNT1Q96Q11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
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