Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ABCC11Q96J66 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC11Q96J66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ABCC11Q96J66 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC11Q96J66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC11Q96J66 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms