Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00526Q96FQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00526Q96FQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00526Q96FQ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms