Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC97Q96F63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC97Q96F63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms