Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCN3Q96D15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN3Q96D15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN3Q96D15 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms