Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
OPTNQ96CV9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
OPTNQ96CV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
OPTNQ96CV9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms