Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3DQ96BQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3DQ96BQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM3DQ96BQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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