Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFT1Q96AA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFT1Q96AA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFT1Q96AA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms