Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC29Q8WV35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC29Q8WV35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC29Q8WV35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms