Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNX29Q8TEQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX29Q8TEQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX29Q8TEQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms