Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI7

TMC2, Transmembrane channel-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC2Q8TDI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMC2Q8TDI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMC2Q8TDI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC2Q8TDI7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC2Q8TDI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms