Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HELQQ8TDG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HELQQ8TDG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HELQQ8TDG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HELQQ8TDG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms