Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 ZNF839-204ENST00000558462 756 ntTSL 311.18□□□□□ -0.623e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 ZNF839-205ENST00000558490 931 ntTSL 211.08□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 BRD8-219ENST00000472478 745 ntTSL 310.28□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.783e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.873e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 TSHZ1-201ENST00000322038 4992 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 TSHZ1-205ENST00000584217 7080 nt8.61□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC8.2□□□□□ -1.13e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.13e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC8.14□□□□□ -1.113e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 DHX57-211ENST00000622155 5519 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.113e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 DHX57-202ENST00000452978 2559 ntTSL 56.73□□□□□ -1.333e-10■■■■■ 67
PUM2Q8TB72 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.487e-17■■■■■ 66.9
PUM2Q8TB72 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.922e-15■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 SIAH1-207ENST00000568007 2683 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.542e-15■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 SIAH1-201ENST00000356721 2415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-15■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-15■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.591e-10■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 66.6
PUM2Q8TB72 THADA-218ENST00000486735 564 ntTSL 411.42□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 THADA-208ENST00000407351 3678 ntTSL 28.57□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 THADA-201ENST00000398653 5900 ntTSL 28.18□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.54□□□□□ -1.524e-9■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.524e-9■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-15■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-15■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-15■■■■■ 66.4
PUM2Q8TB72 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 66.3
PUM2Q8TB72 KDM7A-202ENST00000472616 7943 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 66.3
PUM2Q8TB72 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 39.28□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 66.2
PUM2Q8TB72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.665e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.475e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SEL1L3-209ENST00000513364 611 ntTSL 321.92■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SLBP-203ENST00000480936 558 ntTSL 421.78■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-207ENST00000571804 781 ntTSL 521.36■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 421.02■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 420.83■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 519.36■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF746-204ENST00000471735 541 ntTSL 418.9■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-205ENST00000479194 1025 ntTSL 218.82■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 418.76■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 518.75■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 418.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-208ENST00000572784 538 ntTSL 417.42■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 B4GALT2-206ENST00000485678 943 ntTSL 317.39■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 217.38■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-207ENST00000468428 2200 ntTSL 215.98■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-203ENST00000544714 505 ntTSL 415.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-206ENST00000571487 1629 ntTSL 514.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-203ENST00000441340 708 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-205ENST00000422854 582 ntTSL 414.33□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 65.9
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