RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574941.5

TRAP1-211, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-211ENST00000574941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.51■■■■■ 5.2
TRAP1-211ENST00000574941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.14■■■■■ 4.34
TRAP1-211ENST00000574941 ABCC9O60706 1549 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAP1-211ENST00000574941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.78■■■■□ 3.96
TRAP1-211ENST00000574941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.68■■■■□ 3.94
TRAP1-211ENST00000574941 NACADO15069 1562 aa39.63■■■■□ 3.94
TRAP1-211ENST00000574941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
TRAP1-211ENST00000574941 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.39■■■■□ 3.9
TRAP1-211ENST00000574941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.26■■■■□ 3.88
TRAP1-211ENST00000574941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.72■■■■□ 3.79
TRAP1-211ENST00000574941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.63■■■■□ 3.77
TRAP1-211ENST00000574941 SCRIBQ14160 1630 aa38.56■■■■□ 3.76
TRAP1-211ENST00000574941 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.47■■■■□ 3.75
TRAP1-211ENST00000574941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.04■■■■□ 3.68
TRAP1-211ENST00000574941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.82■■■■□ 3.64
TRAP1-211ENST00000574941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
TRAP1-211ENST00000574941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.29■■■■□ 3.56
TRAP1-211ENST00000574941 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.07■■■■□ 3.53
TRAP1-211ENST00000574941 SMARCA4P51532 1647 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAP1-211ENST00000574941 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
TRAP1-211ENST00000574941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAP1-211ENST00000574941 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAP1-211ENST00000574941 SMARCA2P51531 1590 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAP1-211ENST00000574941 NCAPD3P42695 1498 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAP1-211ENST00000574941 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAP1-211ENST00000574941 HMGXB3Q12766 1538 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAP1-211ENST00000574941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TRAP1-211ENST00000574941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
TRAP1-211ENST00000574941 WIZO95785 1651 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAP1-211ENST00000574941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TRAP1-211ENST00000574941 NESP48681 1621 aa35.75■■■■□ 3.31
TRAP1-211ENST00000574941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.59■■■■□ 3.29
TRAP1-211ENST00000574941 ERCC6Q03468 1493 aa35.59■■■■□ 3.29
TRAP1-211ENST00000574941 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAP1-211ENST00000574941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
TRAP1-211ENST00000574941 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.45■■■■□ 3.27
TRAP1-211ENST00000574941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.4■■■■□ 3.26
TRAP1-211ENST00000574941 CFTRP13569 1480 aa35.35■■■■□ 3.25
TRAP1-211ENST00000574941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
TRAP1-211ENST00000574941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.16■■■■□ 3.22
TRAP1-211ENST00000574941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
TRAP1-211ENST00000574941 CUX2O14529 1486 aa35.12■■■■□ 3.21
TRAP1-211ENST00000574941 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
TRAP1-211ENST00000574941 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.04■■■■□ 3.2
TRAP1-211ENST00000574941 PRDM2Q13029 1718 aa34.99■■■■□ 3.19
TRAP1-211ENST00000574941 WDR62O43379 1518 aa34.89■■■■□ 3.18
TRAP1-211ENST00000574941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
TRAP1-211ENST00000574941 TOPBP1Q92547 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
TRAP1-211ENST00000574941 ABCC8Q09428 1581 aa34.55■■■■□ 3.12
TRAP1-211ENST00000574941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.54■■■■□ 3.12
TRAP1-211ENST00000574941 CUX1P39880 1505 aa34.37■■■■□ 3.09
TRAP1-211ENST00000574941 IFT140Q96RY7 1462 aa34.36■■■■□ 3.09
TRAP1-211ENST00000574941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
TRAP1-211ENST00000574941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.25■■■■□ 3.07
TRAP1-211ENST00000574941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
TRAP1-211ENST00000574941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.063e-7■■■■□ 25.1
TRAP1-211ENST00000574941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.19■■■■□ 3.06
TRAP1-211ENST00000574941 SOGA1O94964 1423 aa34.18■■■■□ 3.06
TRAP1-211ENST00000574941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
TRAP1-211ENST00000574941 SYNJ1O43426 1573 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAP1-211ENST00000574941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
TRAP1-211ENST00000574941 TOP2BQ02880 1626 aa34.06■■■■□ 3.04
TRAP1-211ENST00000574941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.043e-7■■■■□ 25.5
TRAP1-211ENST00000574941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAP1-211ENST00000574941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
TRAP1-211ENST00000574941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.98■■■■□ 3.03
TRAP1-211ENST00000574941 WDR97A6NE52 1622 aa33.9■■■■□ 3.02
TRAP1-211ENST00000574941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.89■■■■□ 3.02
TRAP1-211ENST00000574941 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.78■■■■□ 3
TRAP1-211ENST00000574941 GRIN2BQ13224 1484 aa33.76■■■■□ 3
TRAP1-211ENST00000574941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.74■■■□□ 2.99
TRAP1-211ENST00000574941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.73■■■□□ 2.99
TRAP1-211ENST00000574941 OSCARQ8IYS5 282 aa33.72■■■□□ 2.99
TRAP1-211ENST00000574941 FBLN2P98095 1184 aa33.67■■■□□ 2.98
TRAP1-211ENST00000574941 PBRM1Q86U86 1689 aa33.65■■■□□ 2.98
TRAP1-211ENST00000574941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
TRAP1-211ENST00000574941 CHD1O14646 1710 aa33.59■■■□□ 2.97
TRAP1-211ENST00000574941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
TRAP1-211ENST00000574941 SYNJ2O15056 1496 aa33.53■■■□□ 2.96
TRAP1-211ENST00000574941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.48■■■□□ 2.95
TRAP1-211ENST00000574941 KIF27Q86VH2 1401 aa33.46■■■□□ 2.95
TRAP1-211ENST00000574941 TRIM41Q8WV44 630 aa33.46■■■□□ 2.95
TRAP1-211ENST00000574941 ADAMTS12P58397 1594 aa33.43■■■□□ 2.94
TRAP1-211ENST00000574941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.39■■■□□ 2.94
TRAP1-211ENST00000574941 GRIN2AQ12879 1464 aa33.33■■■□□ 2.93
TRAP1-211ENST00000574941 IGF1RP08069 1367 aa33.31■■■□□ 2.92
TRAP1-211ENST00000574941 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.24■■■□□ 2.91
TRAP1-211ENST00000574941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.2■■■□□ 2.91
TRAP1-211ENST00000574941 CUL7Q14999 1698 aa33.18■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 NUP160Q12769 1436 aa33.17■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 ARHGEF11O15085 1522 aa33.17■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 CEP170Q5SW79 1584 aa33.16■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.14■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.14■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.14■■■□□ 2.9
TRAP1-211ENST00000574941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAP1-211ENST00000574941 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.09■■■□□ 2.89
TRAP1-211ENST00000574941 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.93■■■□□ 2.86
TRAP1-211ENST00000574941 ARAP1Q96P48 1450 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAP1-211ENST00000574941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.89■■■□□ 2.86
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