Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD1Q8NHV4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEDD1Q8NHV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NEDD1Q8NHV4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEDD1Q8NHV4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms