Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPD5Q8NDF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAPD5Q8NDF8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPD5Q8NDF8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPD5Q8NDF8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms