Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RETREG2Q8NC44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RETREG2Q8NC44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RETREG2Q8NC44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms