Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf106Q8NAJ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf106Q8NAJ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf106Q8NAJ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms