Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPAP2Q8IXW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPAP2Q8IXW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPAP2Q8IXW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPAP2Q8IXW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPAP2Q8IXW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms