Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPALPP1Q8IXQ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPALPP1Q8IXQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPALPP1Q8IXQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms