Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOT1Q8IXI2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT1Q8IXI2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT1Q8IXI2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms