Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPA2Q8IWL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA2Q8IWL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms