Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATAD2AQ86YP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATAD2AQ86YP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATAD2AQ86YP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATAD2AQ86YP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2AQ86YP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATAD2AQ86YP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms