Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC28Q86X40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC28Q86X40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC28Q86X40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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