Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC3Q7Z5M5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC3Q7Z5M5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC3Q7Z5M5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms