Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA1AQ71U36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA1AQ71U36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA1AQ71U36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms