Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BNC2Q6ZN30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC2Q6ZN30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC2Q6ZN30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.8 ms