Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMOD2Q6P5Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMOD2Q6P5Q4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMOD2Q6P5Q4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms