Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TTC41PQ6P2S7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTC41PQ6P2S7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTC41PQ6P2S7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms