Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP3Q6NUK4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP3Q6NUK4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP3Q6NUK4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms