Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8EQ6NSJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC8EQ6NSJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms