Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BROXQ5VW32 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BROXQ5VW32 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms